A Farmácia Jr. (FJr) é composta por seis Departamentos e suas atribuições:
Além disso, a empresa conta com um Conselho Consultivo e Fiscal (CCF), composto por membros da FJr encarregados de dar suporte ao atual corpo da empresa, constantemente em mudança. Cada diretoria é liderada por uma Diretora ou um Diretor, responsáveis por garantir o direito de expressão de todos os membros bem como a aplicação e respeito às decisões tomadas pelo grupo. A igualdade de direitos entre os membros é destacada no nosso organograma radial.
A responsabilidade do membro é diretamente relacionada ao cargo, sendo o Diretor Presidente o maior responsável pela empresa, seguida dos demais Diretores. As atividades do Conselho Consultivo e Fiscal, Diretoria Executiva e Assessoria são divididas conforme sua complexidade. As atividades rotineiras dos departamentos são de responsabilidade dos assessores enquanto a fiscalização, o planejamento e execução de atividades mais complexas são de responsabilidade dos Diretores. Aos Conselheiros cabe acompanhar e manter funcionando o planejamento estratégico da empresa.
Os departamentos têm suas atividades específicas que estão interligadas e devem ser realizadas em conjunto, respeitando o espaço do outro. As decisões devem ser tomadas em conjunto por todos os Diretores, para que não se sobreponha a importância de uma Diretoria sobre a outra. Deve haver boa comunicação e entendimento entre os departamentos para que as atividades tenham bom andamento e sejam desenvolvidas com harmonia.